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El IBioBA- CONICET- MPSP está emplazado en el Polo Científico Tecnológico, en la Ciudad Autónoma de Buenos Aires.


En ese mismo centro se encuentran el Ministerio de Ciencia (MINCyT), la Agencia Nacional de Promoción Científica y Tecnológica (ANPCyT); el Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas (CONICET); el Centro Cultural de la Ciencia (C3); y otros Institutos de Investigación: el Centro Interdisciplinario de Estudios en Ciencia, Tecnología e Innovación (CIECTI); el Centro Bilateral de Diseño Industrial "Tomás Maldonado" (CEBIDI); el Centro de Simulación Computacional Para Aplicaciones Tecnológicas (CSC, CONICET); y el Centro de Investigaciones en Bionanociencias “Elizabeth Jares-Erijman” (CIBION, CONICET).